次世代シークエンス解析
Nova-seq, Next-seq, Mini-Seq(イルミナ社)
Ion S5, Ion Torent(サーモフィッシャー社)
Ion S5, Ion Torent(サーモフィッシャー社)
山口大学 大学研究推進機構 総合科学実験センター 遺伝子実験施設
担当:教授 水上洋一 E-Mail:こちら
DNA/RNA抽出:Qiagen RNeasyキットやMaxwellRSCキットなどサンプルに応じて対応
自動分注システム:JANUS(パーキンエルマー社)、Biomek4000(ベックマンコールター社)
自動分注システム:JANUS(パーキンエルマー社)、Biomek4000(ベックマンコールター社)
サービス内容について
- RNAやDNA抽出から次世代シーケンス解析、データ解析(トリミング・マッピング、TPMやRPKM計算)まで行いエクセルファイルで返却します。
- 初めての方でも次世代シーケンス解析がご利用いただけるシステムになっています。希望者には共同研究で多変量解析やパスウエイ解析を行うことも可能です。
料金について・サービスご利用にあたっての注意点
- RNA抽出:1サンプル1,700円 サンプルに合わせた最適なキットを選択しDNase処理を行い、吸光、蛍光分析、バイオアナライザーで確認し、次世代シーケンス用の高純度RNAを精製します。 キャンペーン時には無償対応の場合あります。<
- DNA抽出:1サンプル1,300円 サンプルに合わせた最適なキットを選択しRNase処理を行い、吸光、蛍光分析、バイオアナライザーで確認し、次世代シーケンス用の高純度ゲノムDNAを精製します。 キャンペーン時には無償対応の場合あります。
- RNA-seq解析:1サンプル(2000万リード相当)75,000円 16サンプル以上(2000万リード相当)で55,000円(相乗り可能) 全mRNAを次世代シーケンスで解析しデータ処理を行い、遺伝子発現をTPMやRPKMに補正してご返却します。キャンペーン時は割引きがあります。
- SAGE解析サービス(ヒト、マウス限定):1サンプル 38,000円 全mRNAの2万以上の遺伝子配列の一部を増幅させ、次世代シーケンス解析を行います。ヒトやマウスのほぼすべての遺伝子発現を網羅しており、トランスクリプトーム解析を安価に行うことが可能です。 RNAが分解している場合や極めて微量の場合に有効です。キャンペーン時は割引きがあります。
- DNA解析サービス:1ラン 55,000円~ ゲノムサイズに応じて料金設定しています。ゲノムサイズが小さい場合は相乗りにすることもできます。データは変異解析まで行い、エクセルファイルでご返却します。 Nova-seqでの全ゲノム解析の料金は、2021年11月以降に掲載します。 キャンペーン時は割引きがあります。
サービスの予約方法
電話又はメールで連絡後にホームページから必要書類をダウンロードして申請してください。
HP:こちら
HP:こちら
山口大学 大学研究推進機構 総合科学実験センター 遺伝子実験施設